ДНК-баркодинг ксилобионтных видов грибов и лишайников национального парка “Самурский” (Республика Дагестан, Россия): первые результаты

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

ДНК-штрихкодирование является одним из наиболее эффективных и современных подходов к получению новых сведений о биологическом разнообразии грибов и лишайников в малоизученных и/или уникальных регионах. В результате проведенных исследований получены 16 ДНК-штрихкодов для новых региональных находок ксилобионтных афиллофороидных грибов и лишайников, обитающих на территории Самурского национального парка (Республика Дагестан, Россия). Среди них представлены не только нуклеотидные последовательности ITS ярДНК для образцов, идентифицированных на основании классических микроморфологических методов, но и новые сведения о криптических видах, дифференцируемых с использованием молекулярно-генетического подхода. Таксономический спектр изученных объектов включает представителей родов Coniophora, Dendrographa, Diploicia, Dirina, Evernia, Hyphoderma, Lyomyces, Mycoacia, Opegrapha, Peniophorella, Phanerochaete и Xylodon. Вид Mycoacia aurea приводится впервые для Республики Дагестан и Восточного Кавказа.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

С. В. Волобуев

Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: sergvolobuev@binran.ru
Россия, Санкт-Петербург

А. Б. Исмаилов

Горный ботанический сад Дагестанского федерального исследовательского центра РАН

Email: i.aziz@mail.ru
Россия, Махачкала

Список литературы

  1. Begerow D., Nilsson R.H., Unterseher M. et al. Current state and perspectives of fungal DNA barcoding and rapid identification procedures. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010. V. 87. P. 99–108. https://doi.org/10.1007/s00253-010-2585-4
  2. Hebert P.D., Cywinska A., Ball S.L. et al. Biological identifications through DNA barcodes. Proc. Royal Soc. London, Series B: Biol. Sci. 2003. V. 270 (1512). P. 313–321. https://doi.org/10.1098/rspb.2002.2218
  3. Hubert N., Hanner R., Holm E. et al. Identifying Canadian freshwater fishes through DNA barcodes. PLOS One. 2008. V. 3. Art. e2490. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002490
  4. Ismailov A., Urbanavichus G., Vondrák J. et al. An old-growth forest at the Caspian Sea coast is similar in epiphytic lichens to lowland deciduous forests in Central Europe. Herzogia. 2017. V. 30 (1). P. 103–125. https://doi.org/10.13158/heia.28.1.2015.104
  5. Ismailov A.B., Volobuev S.V. Dirina ceratoniae (Arthoniales, Ascomycota): first record from Russia. Turczaninowia, 2022. V. 25 (3). P. 189–193. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.25.3.17
  6. Ismailov A.B., Volobuev S.V., Ivanushenko Yu.Yu. Alpha diversity of lichenized and aphyllophoroid fungi in two 1ha forest plots in the Samursky National Park (Republic of Dagestan, Russia). South of Russia: ecology, development. 2023a. V. 18 (4). P. 51–63. https://doi.org/10.18470/1992‐1098‐2023‐4‐51‐63
  7. Ismailov A.B., Volobuev S.V., Kataeva O.A. New records of the genus Ramalina (Lecanorales, Ascomycota) in Dagestan with a key to species. Turczaninowia. 2023b. V. 26 (4). P. 31–38. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.26.4.7
  8. Ivanushenko Yu.Yu., Volobuev S.V. Species of Odontia and Tomentella (Thelephorales, Basidiomycota) new to Dagestan, Russia. South of Russia: ecology, development. 2020. V. 15 (3). P. 165–173. https://doi.org/10.18470/1992‐1098‐2020‐3‐165‐173
  9. Kerr K.C., Stoeckle M.Y., Dove C.J. et al. Comprehensive DNA barcode coverage of North American birds. Molecular ecology notes. 2007. V. 7 (4). P. 535–543. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2007.01670.x
  10. Lücking R., Aime M.C., Robbertse B. et al. Unambiguous identification of fungi: where do we stand and how accurate and precise is fungal DNA barcoding? IMA Fungus. 2020. V. 11. Art. 14. https://doi.org/10.1186/s43008-020-00033-z
  11. Nilsson R.H., Wurzbacher C., Bahram M. et al. Top 50 most wanted fungi. MycoKeys. 2016. V. 12. P. 29–40. https://doi.org/10.3897/mycokeys.12.7553
  12. Shneyer V.S., Rodionov A.V. Plant DNA Barcodes. Biology Bull. Reviews. 2019. V. 9 (4). P. 295–300. https://doi.org/10.1134/S207908641904008x
  13. Truong C., Mujic A.B., Healy R. et al. How to know the fungi: combining field inventories and DNA-barcoding to document fungal diversity. New Phytol. 2017. V. 214 (3). P. 913–919. https://doi.org/10.1111/nph.14509
  14. Volobuev S.V. Antrodia hyalina (Polyporales, Basidiomycota), new species to the Caucasus. Botanical Journal of the North Caucasus. 2021. V. 1. P. 28–34. https://doi.org/10.33580/24092444_2021_1_28
  15. Volobuev S.V. Aphyllophoroid fungi of the “Samurskiy” national park (Dagestan). Mikologiya i fitopatologiya. 2020. V. 54 (4). P. 235–243. https://doi.org/10.31857/S002636482004011x
  16. Volobuev S.V. Sidera tibetica (Hymenochaetales, Basidiomycota), a new species to Russia. Mikologiya i fitopatologiya. 2023. V. 57 (6). P. 394–400. https://doi.org/10.31857/S0026364823060156
  17. Volobuev S., Okun M., Ordynets A. et al. The Phanerochaete sordida group (Polyporales, Basidiomycota) in temperate Eurasia, with a note on Phanerochaete pallida. Mycol. Progress. 2015. V. 14. Art. 80. https://doi.org/10.1007/s11557-015-1097-0
  18. Volobuev S.V., Ivanushenko Yu.Yu., Ismailov A.B. Diversity and ecology of poroid fungi (Agaricomycetes, Basidiomycota) of the Gunib Plateau, Dagestan. South of Russia: ecology, development. 2021. V. 16 (3). P. 68–80. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-3-68-80
  19. Volobuev S.V., Shakhova N.V. Monitoring of protected fungal species in Samursky national park. Botanical Journal of the North Caucasus. 2022. V. 2. P. 7–13. https://doi.org/10.33580/24092444_2022_2_7
  20. Xu J. Fungal DNA barcoding. Genome. 2016. V. 59 (11). P. 913–932. https://doi.org/10.1139/gen-2016-0046

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2024